Kierownik Jednostki Organizacyjnej odpowiedzialny jest za zorganizowanie systemu ochrony informacji niejawnych we współpracy z Pełnomocnikiem ds. ochrony informacji niejawnych. W przypadku naruszeń, wynikających z nieprzestrzegania przepisów o ochronie informacji niejawnych może ponosić odpowiedzialność karną. Kodeks karny wskazuje wprost przestępstwa związane z informacjami niejawnymi.
Jedynie dobrze zorganizowany i funkcjonujący system ochrony informacji niejawnych daje pewność, że informacje będą bezpieczne i w prawidłowy sposób przetwarzane. Wszelkie pojawiające się błędy w obszarze ochrony informacji mogą być przesłanką do utraty świadectwa bezpieczeństwa przemysłowego i zdolności do ochrony informacji niejawnych.
